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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原种类炎症因子聊天、寡核苷酸掩盖总成本偏贵或实际操作工艺流程繁琐。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯副教授开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低代价、跨外来物种、全游戏平台兼容的全新解决方案。

杂志简洁

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中完美院隔代基因基因遗传规律规律基因与发展菌物学实验所和中隔代基因基因遗传规律规律基因能够承办的亚太学术交流讨论杂志杂志杂志,坚持创新驱动于报到生命安全完美和临床医学隔代基因基因遗传规律规律基因学范围的媚足性实验效果。JGG 2021年度会影响分子结构7.1,Scopus学术交流讨论杂志杂志杂志评分质量指标CiteScore 9.9,居首JCR 2021年度GENETICS & HEREDITY范围Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY范围Q1区,居首中完美院杂志杂志杂志系统盘菌物学类1区(Top杂志杂志杂志),隔代基因基因遗传规律规律基因学和生化学与分子结构菌物学小类双1区。

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一些 是HEATag

委婉的“二合并”设置

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成的融为一体球蛋白

「wifi定位器」方案 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化绘制(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连到器」模块图片 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引方形码使用共价相连接。

“1+1>2”的功效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样例记号与产品追溯。

Fig1: HEATag各种方面标记符号远离图示图

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实战技巧检则

HEATag又有能开打?

就能够在与众不同生活条件下,变现哺乳期间宠物内部系单内部混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。设计人员为 HEATag 放置了多轮 “各种压力公测”,从生殖细胞结构系到生殖细胞结构核,从常温的到高温,从新鲜范例到固定的范例,全方向检验它的稳定义高性和稳定可信性。

独每轮测评真对辅乳期昆虫肿瘤受损上皮细胞系:科学研究工作人员进行了发源人、鼠、仓鼠以下三个动物群的每种肿瘤受损上皮细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在室内温度下能 HEATag 标记图片后相混测序。后面回笼的 11447 个肿瘤受损上皮细胞中,85.66% 都能可以通过 HEATag 长条码最准适应到原动物群,模板间相互被污染较少,UMAP 聚类介绍法介绍而且马上证明书,HEATag 长条码与动物群特喜欢的人基因遗传组特证高强度共同。 之后,测验状态进一部升级成:学习技术人员品尝在 4℃下图标丰富受损細胞、在常温下图标甲醇固定不动住受损細胞,恐怕能够 图标受损細胞核。然而依旧完美:那些状态下,样例价签与动物群信息均含有极好的各种相关,转换为准率超 95%。即使是甲醇固定不动住会产生少少的转录本交叉重合环保问题,受损細胞核制取会产生一定量 RNA 减少,受损細胞性质的注解然而依旧与丰富样例始终维持保持一致,说明 HEATag 能够 图标差异办理状态下的科学试验样例。

Fig2: HEATag 可在有差异 具体条件下完全单体细胞转录组混样数据分析

也可以标志蒲乳期两栖爬行动物和海上无脊梁骨两栖爬行动物的原代组织细胞

倘若说細胞核系测试测试是 “基本题”,那组织结构样板正是 “浮动题”, 某些样板总是因細胞核类行更复杂、自然环境适合性特种,变成了标识能力的 “疑难问题”,而 HEATag 正好在某些 “疑难问题” 上表现了优缺点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸集体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞实际上能被最准分清,几乎所有最主要神经细胞类型的的聚类分析法結果都清晰度可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋菌物菌物的适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长条码与植物物种转录组具较高不同性,是没有产生因高盐情况出现的 “标上损坏”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可改变喂乳昆虫安排模板多种 scRNA-seq 阐述

Fig4: HEATag可控制最新鲜浅海无脊椎骨昆虫多种 scRNA-seq 了解

HEATag与组织的融入并不会因起转录组的强势优化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在实现图标级任务的另外,不懂对以后的转录类物质析容易造成干涉,能保证了探究数据统计的完美性。

Fig5: HEATag不要的影响样本量的 RNA 描述方式

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未來可期

HEATag 能为单上皮细胞的研究分享什么呢?

HEATag 的实用价值,远不绝于 “解決记号状况”,它的灵协调性性和普遍性,正处于为单神经细胞分析访问更好地机会性

从操作的场景看

HEATag 能扩大从 “简单易行对比具体分析”(如癌公司与普通公司、中药加工与照表)到 “大的大小钻研”(如公司上皮人体细胞图谱画制、高通芯片量选择)的全位置的需求。随着时间推移 PIP-seq、Stereo-cell 等新技巧可括展技巧的发展方向,HEATag 还能拓宽渠道骤大幅提升单上皮人体细胞钻研的通量,动力科学研究团体抓好较大的大小的楼盘。

从跨区域发展潜力来

HEATag 不单单适合于转录组学,还能与表观遗传基因组学、球营养物质组学、个人空间组学等工艺紧密结合,用开发目录和寡核苷酸编码序列,HEATag 就能够轻轻松松融进区别的组学工作流程,不影向卫星信号捉捕长度。一同,由于HEATag还就能够发展趋势单上皮细胞糖组学探析工艺。

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合作共赢信息

拜谱生物工程与陈凯先生获得逐项合作关系需求

最该目光的是,在 HEATag 技術工艺能够 出非常大app潜力股的底色下,拜谱浅海生物技术技術已与北方浅海浅海生物技术合理与建筑工程江西工作的室管理室(香港)陈凯传授获得基本进行合作有意向的。甲乙双方进度表环绕着 HEATag 技術工艺的产业的发展化半空、科学有效的转化等方法展开图深浅通力合作,带动相应高效化益投入、跨种类的单受损生殖受损细胞标志技術工艺更快app于具体科学动画场景,为更好地的工作的室管理室给予高效化、实惠的单受损生殖受损细胞探索软件,注力科学工作的者在受损生殖受损细胞浅海生物技术技術学、浅海浅海生物技术浅海生物技术技術学、疾患原则等层面达成更好地的突破自我
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