在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

的研究结局

1、从光敏的培养细胞核中导出DNA热塑核蛋白

成了添加光交连淀粉酶质-DNA结合物采用LC-MS介绍，做者开发建设没事种转化纯化细则，可从DNA中清要不是是交连淀粉酶质，仅在直射时采用就直接什么是基因组接觸含有DNA交连淀粉酶质。用TRIZOL添加染料质并清除逮捕获的非交连淀粉酶，第二将其重复可溶性高，溶于水的以开始RNase化解。采用超声波截取视频所获资金淀粉酶质交连DNA的添加物，在硫氰酸胍中烧沸转化，并在二钝化硅离心力柱上较大洗衣以清要不是是交连淀粉酶质直顺利完成。采用核酸酶治疗从DNA中增加光交连淀粉酶，并开始胰淀粉酶酶化解采用LC-MS介绍。该的方法被命名为淀粉酶质交连DNA添加或XDNAX。

图1.蛋清质化学交联DNA导出或XDNAX的过程流程图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可随时接受DNA的蛋白酶质图谱

将光热塑步骤运用于MCF7受损神经细胞，遇到了1,805种得票率蛋清，各举1,191种有着于3个或更加多次相似中。60%的DNA互为用组会有核酸融合的GO注脚，在缺泛核酸融合注脚的蛋清质中，较大的贡献者位于核纤层蛋清，再就是是参加脱色质组织结构和受损神经细胞瓦解的蛋清质（图2）。

图2 . 可同时相处 DNA 的蛋白质含量质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3分析了DNA双方使用组所隐藏的氨基酸质-DNA接面下列不属于是指的核苷酸交连肽。这涵盖由（1）球状DNA紧密联系型式域、（2）DNA 紧密联系周期性区（IDR）和（3）由与一些氨基酸质（列举组氨基酸紧密联系氨基酸）、RNA（列举剪接成分）或相转移区室（列举核仁氨基酸）双方使用而使得的学习环境近乎。

图3 . 可简单相处 DNA的设计域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法细胞膜扰动一年后与DNA构建的转录因素

雌刺皮质激素药感觉α（ESR1）驻留下胞质溶胶中，昨天面临其配体，重置易位到癌神经元质，在处它与人类基因组中的某部位运用以激话某的转录程度。将血清饥饿的MCF7癌神经元曝光于高用药量雌刺皮质激素药（10 nM 17β-雌二醇）4分之五钟，与模拟系统净化处理的对比癌神经元相对它的DNA能够 角色组（图4A）。当中，雌刺皮质激素药兴奋后DNA能够 角色组中的ESR1增强了30倍（图4B）。总的再说，在1,814个按量的蛋白质质含量质-DNA能够 角色中，约有9%界面显示出以上2倍的偏态转变，并观察植物到与ESR1具能够 角色的蛋白质质含量如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌孕激素除理乳腺炎癌组织 DNA 相互之间影响组的定量分析较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人心得体会

深入分析进基因遗传遗传组的蛋清质以认知它是怎么样才能被获取并付诸社会实践的，一只是学习成员一两个长期性的的追求幸福。基因遗传遗传组可及性包括以DNA为管理中心的视角通过深入分析，然后，到当今就行，复染质妇科凝胶中的哪几个蛋清质与DNA 发生了初中物理主动效果尚不非常清楚。运用零多远光交连，可表明DNA主动效果组中的绝大部分数蛋清质，XDNAX科技将当作蛋清质-DNA主动效果深入分析的整体实力强大用具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的核苷酸质组学、修饰语组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参考选取文章：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.