
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究方案结论
探索工作人员探究性学习近年来保鲜时候提高羊肉的光洁度、持来说水力、金属光泽度、存在铁纯度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4程度来测试肩部肌肉结构神经元的铁窒息死亡工作状态。数据出现,保鲜时候提高后,羊肉的光洁度在第3天和第6天取得增涨;持水效率大幅度降低;本色变深,失掉金属光泽,鲜大紫色换为暗大紫色。再者,存在铁、灵活性氧和MDA的纯度取得增高,神经元凋亡率取得增加。 科研人群导入有所文化差异保鲜时候的腿部身体肌肉检样的蛋清质,那么完成SDS-PAGE探讨,蛋清质条带在有所文化差异南北朝时期布置一致且是类似的(图1a)。结合蛋清在有所文化差异检样中的表达出情况发生,探讨发现同一时间条组检样的中四位数说出于同一时间条水平方向(图1b),证明腿部身体肌肉检样蛋清质具备有不错的组内是类似的性和组间文化差异形。 核氨基酸组学共鉴别出1996种核氨基酸。以B0为参考组,选择B1、B2、B4和B6中的核血清对其进行对比表明具体分析一下,共鉴别到37几个DEPs。将火山图交互,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个基准具体分析一下DEP。效果如图是1c-f如图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别鉴别出22、33、73和140个DEPs,当中分刘海别上浮6、11、32和87个,下降16、22、41和55个。聚类分析办法测评了的差异冷冻阶段性脂肪集体中核氨基酸的表明,效果表现脂肪核血清表明对比跟随永久保存时的加大而加大(图1g)。
图1| 各种不同食品冷藏时刻的全身肌肉合格品营养物质质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样的保鲜事件的肌肉群仿品性别差异蛋白质数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡血清肽的PRM一定量进行分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG聚集区别理解血清的铁阵亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT按量血清质组学技術提供贴心服务,拜谱生物技能已物料开发顺利完成并设立了进一步优化早熟的转录组学、血清组学、分泌组学已经两组学整合物料技術提供贴心公共服务体系建设,欢迎致电咨询!
决定性资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.